2019年5月2日 星期四

如何讓利用ImageJ自動計算IHC(免疫組織染色)

此篇利用ImageJ這套軟體來計算IHC,在一個視野下所染的marker數量

ImageJ這套軟體是套老軟體了,介紹的人也很多,在這裡不贅述

一般流程,做完IHC(2 days),利用顯微鏡或掃片機拍片(1~2 days)
再用肉眼,手握counter一個一個視野計算(時間依視野而定,2~5 days)
實驗流程大約要花兩週時間

使用ImageJ並熟悉使用方式,可以將計算的時間盡量壓縮到一天以內完成
實驗流程能壓縮至5~6天結束

IHC實驗染色為DAB呈色系統,並使用Hematoxylin染細胞核確定細胞位置
此功能ImageJ 原版就有。而我使用的版本Fiji ,算是ImageJ的分支

2015年1月28日 星期三

簡單的演算法-16進位法

16進位法,簡而概之就是每16個數進位一次

對應表如下:

0  1  2  3  4  5  6  7  8  9  10  11  12  13  14  15
0  1  2  3  4  5  6  7  8  9   a    b   c    d    e    f

16進位小常識

16進位法有很多種不同的使用方式
如ACII等等

但在網頁設計中最常使用的部分
就是表現顏色了

2015年1月25日 星期日

Scratch探索-點陣圖原理

接觸Scratch一陣子
發現真的是非常有趣
對於發展、創造與邏輯上都有不錯的發展性
介面上也十分友善
對於我這種beginner真的是福音啊

利用scratch來驗證點陣圖的效果
點陣圖小知識(WIKI)

建立一個資料格式(如0~7八個數字,對應八種顏色(或灰階))
一一指定數字為何種顏色,一個一個點出圖案
並指定長寬,使其可以作圖畫出來(像是印表機般,一點一點點在紙上)

2015年1月13日 星期二

簡單的演算法隨筆-二進位法

二進位演算法2^n
         1   1   1   1   1   1   1   1
n=    7   6   5   4   3   2   1   0

以上是為8bit 2進位輸入法
所以2^8總共可以表現多少數字呢?
答案是255
(2^7+2^6+…..2^0=255)

+1進位後
會如下
         1 0 0 0 0 0 0 0 0
n=    8 7 6 5 4 3 2 1 0
為9bit
所以,計算最簡單的計算方法
就為2^8-1(不是2^7+1喔!)

2015年1月3日 星期六

Beginner-Linux 嘗鮮(複習?)

一開始
先說聲2015新年快樂!

測試Linux的目的
是為了思考購買筆電過後,學習與日常使用
但目前傾向於買Macbook pro retina..
So...

正文開始
Linux
一開始接觸是Ubuntu
之後有使用過Fedora

重新開始
打算從Ubuntu開始
過了這麼多年
所有分支中Ubuntu已經可以不依靠純文字介面
使用XWindow System來解決大小事了
(還在說X Window好像是老人阿!!!!)

使用雙硬碟雙系統方式
感謝方便的Grub,開機選單上少了很多麻煩
Ubuntu在設定上非常順暢
幾乎是直接安裝直接使用的方式

系統規格:

2014年12月29日 星期一

Beginner/HTML學習筆記-2

很重要但很容易被遺忘=>備註

備註
HTML CSS javascript
<!--要輸入的內容--> /*要輸入的內容*/ //要輸入的內容/*要輸入的內容*/

直接body中調整
<body bgcolor="" background="" text="" link=""(連結) vlink=""(閱讀過) alink=""(正在連結)>

定義清單(<dl>,<dt>,<dd>)
可以使文字如tab般空行
<dl>
<dt>123
<dd>456
<dt>789
<dd>147
</dl>
表格(table)
<table width="" cellspaing="" background="" border=""外框>
<table>
<thead>放置在表格第一行
<tbody>
<tfoot>放置表格最後一行
<td>橫向儲存格
<th>粗體橫向儲存格
<tr>直向下一行
<caption>橫向主題(如上面主題:備註)
<th rowspan="數字">縱向(直向)主題


文字(也可在CSS中控制)
<b>粗  <i>斜  <u>底線
<font fact="">控制字體
<font color=""or#>控制顏色
<font size="">控制大小

<div> 分區or分節(塊狀結構)
可以直接在<div>中更改被<div></div>框選起來的屬性
或是利用<div class="">來將此區域定義
從外匯入屬性(如CSS)

2014年12月20日 星期六

Beginner/HTML學習筆記-1

基本架構
<html>
 <head>
  <!--css與javascript放置在這--> <title>
</title>
</head>
 <body>
  <!--主要內容放置於此-->
</body>
</html>
其中的<body>可加入屬性使在body內無設定屬性的內容統一格式如:
bgcolor(背景顏色)、background(背景圖案,可用連結)、text(文字顏色)
、link(連結)&vlink(閱讀過後)&alink(正在閱讀)
P.S:如在body內的內容有另外設定屬性,則會使用該屬性
P.S2:
css連結方法如:
<link rel="stylesheet" type="text/css" href="css/style.css" /></head>

javascript連結方法如:<scripttype="text/javascript" src="javascript/dreamdu.js"></script>
水平分線<hr>